Área de Historia Moderna
- Instituciones y Administración en la España Moderna.
- Mentalidades y comportamientos colectivos, especialmente educación y religiosidad.
- Historia de la vida cotidiana.
- Historia cultural.
- Libros y lectores en la España Moderna.
- Religiosidad popular y cofradías en el Antiguo Régimen.
- La Justicia en la Edad Moderna.
- Historia social del ejército y la milicia.
- Iglesia y sociedad en la España del Antiguo Régimen.
- Influencia política y social de la Compañía de Jesús (siglos XVI-XVIII).
- Demografía histórica.
- Historia de la Diplomacia y las Relaciones internacionales.
- Historia de la población y los modelos familiares en la España Moderna.
- El Reino de Granada en la Edad Moderna.
- Repoblación y colonización: el modelo andaluz y su proyección americana.
- Minorías de origen musulmán (mudéjar y moriscos) en el Reino de Granada.
- Historia de las mujeres.
Área de Historia de América
- Andalucía y América en los siglos XVII y XVIII.
- Historia de la sexualidad, de la criminología y la justicia penal en América Latina (siglos XIX y XX)